??酶通常有習慣命名和系統命名兩種方法。

??習慣命名

??常根據兩個原則：

??1.酶的作用底物，如淀粉酶;

??2.催化反應的類型，如脫氫酶。

??也有根據上述兩項原則綜合命名或加上酶的其它特點，如琥珀酸脫氫酶、堿性磷酸酶等等。

??習慣命名較簡單，習用較久，但缺乏系統性又不甚合理，以致造成某些酶的名稱混亂。如：腸激酶和肌激酶，從字面看，很似來源不同而作用相似的兩種酶，實際上它們的作用方式截然不同。又比如：銅硫解酶和乙酰輔酶A轉酰基酶實際上是同一種酶，但名稱卻完全不同。

??鑒于上述情況和新發現的酶不斷增加，為適應酶學發展的新情況，國際生化協會酶委員會推薦了一套系統的酶命名方案和分類方法，決定每一種酶應有系統名稱和習慣名稱。同時每一種酶有一個固定編號。

??系統命名

??酶的系統命名是以酶所催化的整體反應為基礎的。

??例如一種編號為“3.4.21.4”的胰蛋白酶，

??第一個數字“3”表示水解酶;

??第二個數字“4”表示它是蛋白酶水解肽鍵;

??第三個數字“21”表示它是絲氨酸蛋白酶，活性位上有一重要的絲氨酸殘基;

??第四個數字“4”表示它是這一類型中被指認的第四個酶。

??規定，每種酶的名稱應明確寫出底物名稱及其催化性質。若酶反應中有兩種底物起反應，則這兩種底物均需列出，當中用“：”分隔開。

??例如：谷丙轉氨酶(習慣名稱)寫成系統名時，應將它的兩個底物“L-丙氨酸”“α-酮戊二酸”同時列出，它所催化的反應性質為轉氨基，也需指明，故其名稱為“L-丙氨酸：α-酮戊二酸轉氨酶”。

??由于系統命名一般都很長，使用時不方便，因此敘述時可采用習慣名。

??酶類(酵素)類產品是糖和水果進行發酵之后的產物，也就是“水果泡菜”加上“低度甜味水果酒”的混合物。比如一種青梅全發酵(非浸泡的)的低度果酒。